1.溶解氧

首先必須在厭氧區嚴控制的厭氧環境，這直接關系到聚磷菌的生長狀況、釋磷能力及利用有機基質合成PHB的能力。

其次是必須在好氧區供給足夠的溶解氧，以滿足聚磷菌對儲存的PHB進行降解，釋放足夠的能量供其過量攝磷。一般厭氧段的DO要嚴格控制在0.2mg/L以下，而好氧段的DO要嚴格控制在2mg/L以上。

2.硝態氮

硝態氮包括硝酸鹽和亞硝酸鹽，硝態氮的存在也會消耗有機基質而抑制聚磷菌對磷的釋放，從而影響好氧條件下聚磷菌對磷的吸收。

另外，硝態氮的存在會被部分聚磷菌作為電子受體進行反硝化，從未影響其以發酵產物作為電子受體進行發酵產酸、抑制聚磷菌的釋磷和攝磷能力及PHB的合成能力。

3.溫度&pH值

一般來說，在5~30℃范圍內，都可以收到較好的除磷效果。

pH值在6~8范圍內，磷的釋放比較穩定。

4.BOD負荷和有機物性質

一般認為，進水中的BOD5/TP要大于15，才能保證聚磷菌有足夠的基質，從而獲得理想的除磷效果。為此，可以采用部分進水和跨越初沉池的方法，獲得除磷所需的BOD5量。

泥齡：一般以除磷為目的的生物處理系統的泥齡控制在3.5~7d。